[5.01] Simple mortel / Arrival : Clark découvre la Forteresse de Solitude. Jor-El lui explique qu'il doit débuter son apprentissage afin d'être prêt pour sauver cette planète. Lana est témoin du crash d'un vaisseau spatial.

[5.02] Haute trahison / Mortal : Jor-El prive Clark de ses pouvoirs, faisant de lui un humain. Ravi d'être finalement "normal", Clark poursuit sa relation avec Lana. Cependant après que Lana, Jonathan et Martha soient prit en otage par trois gangsters, Clark doit trouver une solution pour sauver sa famille sans ses super pouvoirs

[5.03] Sacrifice / Hidden : Lorsque Lois tombe inconsciente dans un lac, Clark tente de la sauver mais il est devancé par Arthur Curry, qui se révèlera être Aquaman. Il est à Smallville pour empêcher d'utiliser son arme, le Léviatan, qui détruira toute vie marine à ses alentours. Plus tard, Milton Fine, le professeur d'histoire de Clark, lui propose un poste d'assistant.

[5.04] Aquaman / Aqua : Chloe est avertie par Gabriel qu'il va déclencher un missile et ainsi détruire Smallville. Toujours privé de ses pouvoirs, Clark s'oppose à Gabriel et finit par être blessé par balle. A l'hôpital, son électrocardiogramme est plat et son destin est placé entre les mains de Jor-El. Pendant ce temps, Lex croit que Lionel a la clef pour ouvrir le vaisseau spatial.

[5.05] Le bal des vampires / Thirst : Lana décide de s'inscrire à l'université de Metropolis à la dernière minute et se voit contrainte de rejoindre une sororité pour trouver un logement. Le leader parlementaire Buffy Sanders, et ses consoeurs, lui offrent plus qu'un endroit où rester quand ils la transforment en vampire. Lex offre un antidote à Clark qui le donne à Lana, et LuthorCorp se révèle être connecté à des vampires. Chloe gagne un stage au Daily Planet.

[5.06] Un vieil ami / Exposed : Le sénateur Jack Jennings, le plus vieil ami de Jonathan, arrive à la ferme des Kent pour recherchez de l'aide dans sa campagne pour une réélection. Quand une strip-teaseuse se présente morte, et se révèle être la maîtresse de Jennings, Jennings est le suspect principal. Pour chercher des réponses, Chloe et Lois convainc d'aller banalisé comme une strip-teaseuse, mais les choses prennent une tournure dangereuse lorsque Lois est kidnappée par le fils d'un diplomate étranger, qui a l'intention de la vendre en esclavage.

[5.07] À cran / Splinter : Clark est exposé à une nouvelle sorte de kryptonite, la kryptonite argentée, l'obligeant à avoir des idées délirantes paranoïdes de ces proches. Cette kryptonite lui fait croire que Chloe va révéler son secret, que Jonathan est intrigué contre lui avec Lionel et que Lex et Lana entretiennent une relation secrète. Chloé et les Kent recherchent désespérément un remède, mais c'est le professeur Fine qui vient au secours de Clark. Il prétend être un Kryptonien.

[5.08] Pris au piège / Solitude : Quand Martha contracte une étrange maladie, Clark se tourne vers le Professeur Fine, qui convainc Clark que Jor-El est le responsable de sa maladie. Fine convainc Clark que la seule manière de sauver est de détruire la Forteresse de Solitude, le séparant définitivement de Jor-El. Une fois qu'ils arrivent tous les deux dans la forteresse, Fine se révèle être une intelligence artificielle créée par les Kryptoniens et tente de libérer Zod de la Zone Fantôme.

[5.09] L'esprit de Noël / Lexmas : C'est noël, Clark et Chloé joue au père noël pendant que Lex rêve de son avenir s'il abandonnait son père. Lex veut trouver, ou créer, des informations compromettantes contre Jonathan pour bouleverser sa race sénatoriale, quand il croise des jeunes qui lui tire dessus et il tombe dans le coma et est visité par le fantôme de sa mère. Elle lui montre une vie sans son père, où Lex est marié à Lana, et les deux attendent un deuxième enfant.

[5.10] Fanatique / Fanatic : La vie de Jonathan est menacé par une source mystérieuse, qui le pousse à abandonner la course sénatorial. Clark découvre que les adeptes de Lex, principalement Samantha Drake, sont déterminés à faire quelque chose de voir que Lex remporte les élections sénatoriales. Lois est menacée dans l'assassinat de Jonathan pendant son discours au Sénat. Lionel offre à Martha un peu d'argent en secret pour aider à la campagne de Jonathan, tandis que Lana estime que les réponses qu'elle cherche résident dans la première pluie de météores.

[5.11] Engrenage / Lockdown : Deux faux policiers, dont l'un des deux est témoin de la venue des Kryptoniens dans la deuxième pluie de météorites, prennent Lex et Lana en otage et menacent de les tuer si Lex ne révèle pas où il a caché le vaisseau spatial. Il prend une balle destinée à Lana, et craignant qu'il ne saigne à mort, elle lui demande de dire aux agents l'emplacement du vaisseau. Clark découvre que Lana a fait des recherches sur le vaisseau avec Lex et craint qu'elle ne soit proche de la découverte de son secret.

[5.12] Pour le meilleur et pour le pire / Reckoning : Clark révèle son secret à Lana, il l'emmène voir la Forteresse et la demande en mariage.Le père de Clark est élu sénateur du Kansas au détriment de Lex. Lana se fâche avec Lex et prend la route quand un bus percute sa voiture et la tue sur le coup. Clark s'en veut de ne pas avoir pu la sauver et décide de retourner à la Forteresse parler à Jor-El et lui demander son aide.

[5.13] L'ange de la vengeance / Vengeance : Lorsque sa mère est agressé à Metropolis, Clark décide de savoir quel était celui qui lui a sauvé la vie. Il découvre le nouveau journaliste au Daily Planet, une femme nommée Andrea Rojas, est en fait un vengeur masqué qui combat le crime la nuit. Clark toujours dans la douleur de la perte de son père menace pour obtenir le meilleur de lui comme il se joint à Andrea dans sa lutte contre la criminalité.

[5.14] Possédée / Tomb : L'esprit d'une jeune fille est libéré de sa tombe après que la foudre frappe un bracelet en kryptonite qu'elle portait. Clark trouve le cadavre dans les murs du Talon et l'esprit rentre dans le corps de Chloé après qu'elle a touché le bracelet de kryptonite. Clark suit les traces de l'esprit qui essaie de trouver son assassin qui tyrannisait les filles à Smallville des 10 dernières années. Quand Lois est subitement kidnappée, Chloé va venir à son secours.

[5.15] Le cyborg / Cyborg : Un médecin sympathique sorti un objet mi-human/mi-machine nom de Victor Stone retenu captif et expérimenté par LuthorCorp. Clark devient ami avec Victor et lui promet de retrouver sa petite amie, mais Lex piège Victor et le ramène à la LuthorCorp. Clark aide Victor à se libérer pour de bon. Pendant ce temps, Martha est l'objet de chantage, et Lionel propose d'intervenir et de traiter avec le maître-chanteur. Il est plus tard révélé que Lionel connaît le secret de Clark.

[5.16] Hypnose / Hypnotic : Lex va chercher le professeur Fine dans la jungle du Honduras. Clark rencontre une belle séductrice prénommée Simone qui hypnotise les gens afin de les utiliser à son gré. Clark, ensorcelé, lui révèle ses pouvoirs et celle-ci saisit l'occasion : après avoir forcé Clark à rompre avec Lana, elle lui demande de tuer Lex, qui détient des informations compromettantes sur elle.

[5.17] L'au-delà / Void : Chloe découvre que le professeur Fine est encore vivant et avertit Clark, qui se met à le rechercher. Lana, encore bouleversée par leur rupture, expérimente un médicament à base de kryptonite qui lui permet de voir ses parents décédés. Clark, inquiet, se précipite pour empêcher Lana de se blesser, mais finit par être en contact avec le sérum de kryptonite. Lorsque Clark tombe dans le coma, il est capable de parler à son père, qui le prévient que Lionel connaît son secret.

[5.18] Sœur de cœur / Fragile : Clark et Martha prennent chez eux une petite fille, Maddie, après que sa mère adoptive est été brutalement poignardée à mort. Maddie devient le principal suspect, du moins aux yeux de Lois, quand on découvre qu'elle a le pouvoir de manipuler le verre. Le père de Maddie arrive à sa demande et se révèle être le véritable assassin. Lois accepte un emploi en tant que chef d'état-major de Martha, et Chloé surprend Lex et Lana pendant un moment d'intimité.

[5.19] Aucune pitié / Mercy : Après avoir tenté de prendre le contrôle de LuthorCorp, un employé mécontent prend en otage Lionel, et orchestre une série de jeux élaborés que Lionel doit gagner pour rester en vie. Clark dit à Martha que Lionel connaît son secret. Elle devient par inadvertance un pion dans le jeu du bourreau et finit par se battre pour sa propre vie.

[5.20] Invisible / Fade : À Metropolis, Clark sauve la vie d'un étranger nommé Graham, qui jure de lui rendre la pareille. Malheureusement, Graham se trouve être un tueur à gages avec la possibilité de devenir invisible, et il décide que tuer Lex serait le meilleur cadeau qu'il pourrait offrir à Clark. Pendant ce temps, Lana avoue à Clark que sa relation avec Lex devient de plus en plus sérieuse.

[5.21] Oracle / Oracle : Clark est stupéfait quand il voit le fantôme de son père au cimetière, mais devient encore plus confus quand Jonathan lui dit qu'il doit tuer Lionel. Jonathan apparaît de nouveau et donne à Martha le même message. Lex développe un vaccin contre le virus mortel de Fine, mais ce dernier intervient et lui injecte une dose du médicament. Clark réalise que Jonathan est en réalité Milton Fine, et que Jor-El prend possession de Lionel pour le détruire

[5.22] L'hôte du diable/ Vessel : Fine libère un virus informatique qui paralyse tous les systèmes afin de déclencher une panique générale et la destruction de la Terre, et refuse de le stopper à moins que Clark accepte de libérer Zod. Clark se tourne vers Jor-El et apprend que Zod a besoin d'un corps à habiter. Clark doit détruire ce nouveau corps, qui s'avère être celui de Lex. Ce dernier est stupéfait par ses nouveaux pouvoirs et partage la découverte avec Lana, qui décide de le soutenir, ignorant les véritables intentions de Fine.

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